自然综述年度回顾年肠道菌群研

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今天是第期日报。

NatureReviews：大数据和微小蛋白质——照亮肠道菌群的黑暗角落（年度回顾）

NatureReviewsGastroenterologyandHepatology[IF:23.57]

①肠道菌群研究持续迅速增多，今年有3份关于新技术和数据库的研究填补了肠道菌群研究的未知；②改进的Gut-on-a-chip系统允许肠道上皮细胞与复杂的无氧微生物群落共同稳定培养稳定5天，逼近模拟人类肠道真实环境；③最新的宏基因组挖掘工作发现了能提供细胞微观环境信息的肠道共生菌群的微小蛋白；④炎症性肠病（IBD）患者的多组学研究发现个体间差异为最主要差异，且患者肠道菌群组成相较对照组失调，但菌群在IBD中的角色未知。

Bigdataandtinyproteins:shiningalightonthedarkcornersofthegutmicrobiome11-27,doi:10./s---6

NatureReviewsGastroenterologyandHepatology的这篇年度综述介绍了2年肠道菌群领域具有创新性的3份研究：1）“gut-on-a-chip”系统：介于传统体外培养和体内培养之间的离体培养技术；2）微小蛋白：过去困于技术水平而被人忽略的蛋白，是分泌蛋白或膜蛋白的重要组成部分；3）迄今为止对IBD最完善的多组学研究进展。新技术为未来肠道菌群研究提供了更多的工具选择。（

潇洒小姐陈）

脂多糖参与诱导非酒精性脂肪肝

Hepatology[IF:14.]

①非酒精性脂肪肝炎（NASH）患者体内血浆脂多糖（LPS）浓度及肝脏LPS定位增加，与血浆连蛋白和pNF‐κB表达有关；②NASH小鼠具有相同的LPS增加情况，其与NF‐κB途径激活有关；③NASH患者体内的Toll样受体4阳性（TLR4+）巨噬细胞高于非酒精性脂肪变性患者和对照组，其与血浆LPS浓度相关；④用阿司匹林和TLR4抑制剂处理小鼠，分别可以缓解肝纤维化程度以及肝脏炎症；⑤E.ColiLPS通过TLR4途径诱导巨噬细胞和血小板激活，进而损伤肝脏。

Increasedliverlocalizationoflipopolysaccharidesinhumanandexperimentalnon‐alcoholicfattyliverdisease12-06,doi:10./hep.

文章综合了NASH患者的临床检测以及NASH小鼠模型，探究了NASH与血浆以及肝脏LPS的关系。结合人体和小鼠的实验研究结果，LPS通过TLR4途径诱导巨噬细胞和血小板激活，进而引发炎症反应，带来肝脏损伤。（

兵兵）

Science子刊：诊断坏死性小肠结肠炎的潜在标记物

Scienceadvances[IF:12.]

①纳入名早产儿，名健康个体，34名患坏死性小肠结肠炎(NEC)，对份粪便样本进行宏基因组分析；②考虑的特征包括菌株类型、真核生物、噬菌体、质粒和生长速率等；③与健康组相比，NEC组肺炎克雷伯氏菌丰度更高，NEC确诊前细菌复制率更快，特别是肠杆菌科；④机器学习发现，NEC组中克雷伯氏属、编码菌毛蛋白细菌及含次级代谢物基因簇（细菌素、与群体感应相关的丁内酯）的细菌增多；⑤以上发现或可用于NEC早期诊断及微生物靶向治疗。

Necrotizingenterocolitisisprecededbyincreasedgutbacterialreplication,Klebsiella,andfimbriae-encodingbacteria12-11,doi:10.1/sciadv.aax

坏死性小肠结肠炎是一种肠道炎症疾病，可发展为肠坏死、败血症，并能造成婴儿死亡，但病因尚不明确。Scienceadvances最近的研究，招募名早产儿，分别对正常婴儿和患坏死性小肠结肠炎婴儿的肠道菌群进行了宏基因组分析，并用细菌复制速率、KEGG模块、次级代谢物基因簇等特征进行机器学习，鉴定出坏死性小肠结肠炎发生相关的可能因素，其中细菌增长速率为最强的预测因子。本研究结果或可用于坏死性小肠结肠炎的早期诊断及之后的微生物靶向治疗。（

nana）

婴儿从母亲那里继承的菌群比病毒多

Microbiome[IF:10.]

①母体菌群很大程度上决定了婴儿的菌群；②婴儿体内63%的细菌群来源于母体，但只有15%的病毒组继承于母体；③来源于母体的细菌群和病毒组比例情况不受分娩方式的影响；④但是，细菌-噬菌体的相互作用受分娩方式的影响；⑤与非相关婴儿相比，婴儿体内的细菌群和病毒组的组成与孪生兄妹更类似，其可能源于相同的环境暴露；⑥不同微生物在代际之间传递的差异，可能预示着菌群的形成受多方面影响。

Discordanttransmissionofbacteriaandvirusesfrommotherstobabiesatbirth12-10,doi:10./s---7

研究纳入28对双胞胎及他们的母亲，探究婴儿体内的肠道菌群和病毒与相应母体组成的差异。研究结果表明，婴儿从母亲那里继承的菌群要远远高于病毒，但具体比例并不受分娩方式的影响。双胞胎的两个个体，其菌群组成更类似，可能源于相同的环境暴露。同时，两者菌群的不同也预示着个体整个菌群社区的形成受多种因素的控制和影响。（

兵兵）

肠道菌群代谢通路影响IBS患者对饮食干预的应答

GutMicrobes[IF:7.]

①22名对乳糖、果糖或山梨糖醇吸收不良的IBS患者，进行2周的糖去除饮食干预后，进行4周的糖再摄入；②根据IBS患者对饮食干预的临床应答，分为应答者与不应答者；③根据对粪便菌群的16SrRNA的测序结果，应答者与不应答者在肠道菌群的多样性及组成上仅有微小差异；④通过宏基因组测序分析，发现应答者与不应答者的肠道菌群代谢通路存在显著差异，包括淀粉降解、复杂氨基酸的生物合成等IBS相关通路在应答者中显著富集。

Changesingutmicrobialmetagenomicpathwaysassociatedwithclinicalout